1267539-32-1
中文名稱
Cy5-疊氮
英文名稱
Cyanine5 azide
CAS
1267539-32-1
分子式
C35H45ClN6O
分子量
601.24
MOL 文件
1267539-32-1.mol
更新日期
2025/06/21 15:10:39
1267539-32-1 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
花青5疊氮化物花菁染料CY5疊氮
花菁染料疊氮 CY5 AZIDE
2-(5-(1-(6-((3-疊氮丙基)氨基)-6-氧代己基)-3,3-二甲基吲哚-2-亞基)戊-1,3-二烯-1-基)-1,3,3-三甲基-3H-吲哚-1-鎓氯化物
英文別名
Cyanine5 azide 所屬類別
材料化學(xué)：發(fā)光材料物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深藍(lán)色固體
ex/em : 640/664 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 250000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.2
ex/em : 640/664 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 250000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.2
溶解度Soluble in DMSO, DMF, DCM
形態(tài)Solid
顏色Light brown to brown
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))250000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.2
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)640/664 nm (PBS buffer)
常見問題列表
概述
Cy5-疊氮 是一種有效的熒光染料。Cyanine5 azide chloride 可通過銅催化點(diǎn)擊反應(yīng) (CuAAC) 與末端炔烴反應(yīng)。(λex=646 nm, λem=662 nm)。它含有 Azide 基團(tuán)，可以和含有 Alkyne 基團(tuán)的分子發(fā)生銅催化的疊氮-炔環(huán)加成反應(yīng)（CuAAc)。它還可以和含有 DBCO 或 BCN 基團(tuán)的分子發(fā)生環(huán)張力促進(jìn)的炔-疊氮環(huán)加成反應(yīng) (SPAAC)。熒光標(biāo)記染料
Cy5 (Cyanine 5) 是一種發(fā)遠(yuǎn)紅(far-red)熒光的花青素?zé)晒馊玖稀Ｋ南庀禂?shù)很高，熒光很亮，并且對(duì)pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激發(fā)然后用 Cy5或APC濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用。Cy5熒光落在遠(yuǎn)紅光區(qū)，使用Cy5或者其它遠(yuǎn)紅光染料的一個(gè)重要優(yōu)勢(shì)是在這個(gè)長波長光譜范圍內(nèi)樣品背景熒光較低，而在這個(gè)區(qū)域CCD相機(jī)/檢測(cè)器檢測(cè)靈敏度最高。Cy5可以用來標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，核酸分子，納米粒等。疊氮(azide)是常用生物標(biāo)記基團(tuán)。通過點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)(click chemistry)，疊氮可以和一系列炔烴(alkyne)或環(huán)炔烴(strained alkyne)生成穩(wěn)定的生物鏈接(bioconjugate)。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)效率很高，可在水相中(也可有機(jī)相)快速定量完成(幾乎100%產(chǎn)率)，即使在低濃度(μM)和低溫(4oC)下也可完成。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)技術(shù)發(fā)展很成熟，各種相關(guān)試劑商業(yè)可得，各種生物標(biāo)記應(yīng)用廣泛。
Cy5標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是640/664nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
注意事項(xiàng)
- Cy5-疊氮水溶性較低，如需在水相中標(biāo)記可選擇磺化Cy5-疊氮。
- 疊氮化合物可被強(qiáng)還原劑(如DTT)還原破壞，使用時(shí)務(wù)必去除還原劑。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因?yàn)榇蟛糠譄晒饣衔镌趶?qiáng)光下長時(shí)間照射會(huì)緩慢光漂泊(photobleaching)。