1469277-96-0
中文名稱
CY5.5 N-羥基琥珀酰亞胺酯
英文名稱
1H-Benz[e]indolium, 2-[5-(1,3-dihydro-1,1,3-trimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene)-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,1-dimethyl-, chloride (1:1)
CAS
1469277-96-0
分子式
C44H46ClN3O4
分子量
716.32
MOL 文件
1469277-96-0.mol
更新日期
2025/08/01 19:26:43
1469277-96-0 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
氰基CY5.5琥珀酰亞胺脂 英文別名
Cy5.5 NHS1H-Benz[e]indolium, 2-[5-(1,3-dihydro-1,1,3-trimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene)-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,1-dimethyl-, chloride (1:1)
所屬類別
有機(jī)原料：氨基化合物物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深藍(lán)色固體
ex/em : 680/698 nm （EtOH/PBS緩沖液）
消光系數(shù)(ε) : 198000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.20
ex/em : 680/698 nm （EtOH/PBS緩沖液）
消光系數(shù)(ε) : 198000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.20
溶解度易溶于DMF等有機(jī)溶劑
形態(tài)Solid
顏色Purple to purplish red
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))198000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.20
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)680/698 nm (EtOH/PBS buffer)
InChIKeySWLMDNMICOSZPR-UHFFFAOYSA-M
SMILESCC1(C(=[N+](CCCCCC(=O)ON2C(CCC2=O)=O)C2C=CC3=CC=CC=C3C1=2)C=CC=CC=C1N(C2C=CC3=CC=CC=C3C=2C1(C)C)C)C.[Cl-]
常見問題列表
概述
CY5.5 N-羥基琥珀酰亞胺酯 是一種活性染料，用于標(biāo)記蛋白質(zhì)，抗體和小分子化合物。熒光標(biāo)記染料
Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一種發(fā)近紅外（NIR）熒光的花青素?zé)晒馊玖?。它的消光系?shù)高，熒光也很亮，并且對pH不敏感，并且由于它的熒光波長（Em：~700nm）恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域（肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長波長穿透性強(qiáng)），所以Cy5.5常應(yīng)用于小動(dòng)物活體體內(nèi)成像中。 Cy5.5可以用來標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，納米粒等，它最常見的使用是標(biāo)記核酸分子（DNA和RNA）。NHS活化酯 （N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物標(biāo)記反應(yīng)中最常用的活化基團(tuán)。它活化Cy5.5分子中的羧基，讓它可以和目標(biāo)生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反應(yīng)生成穩(wěn)定的酰胺鍵，從而把Cy5.5分子標(biāo)記到生物大分子上。由于游離胺基是蛋白，抗體，多肽表面的常見官能團(tuán)（來自于賴胺酸側(cè)鏈），Cy5.5-NHS可以和它們直接反應(yīng)。核酸分子中天然不帶游離胺基，只有胺基修飾過的RNA或者DNA才可以和Cy5.5-NHS反應(yīng)。
Cy5.5-NHS活化酯的水溶性較低，所以在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)需要使用有機(jī)共溶劑，常用有機(jī)溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標(biāo)記的分子對有機(jī)溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即sulfo-Cy5.5-NHS活化酯（ ）。兩者的光譜性質(zhì)幾乎一致，因此大部分應(yīng)用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機(jī)共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強(qiáng)標(biāo)記效率。
注意事項(xiàng)
- NHS ester基團(tuán)對濕度比較敏感，務(wù)必干燥保存產(chǎn)品。使用前產(chǎn)品需放到室溫回溫至少20分鐘。
- 使用不含氨基的緩沖體系。比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液，或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等。高濃度咪唑(imidazole)也會(huì)影響反應(yīng)。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因?yàn)榇蟛糠譄晒饣衔镌趶?qiáng)光下長時(shí)間照射會(huì)緩慢光漂泊。