2097714-45-7
中文名稱
Cy5.5-氨基
英文名稱
Cyanine5.5 amine
CAS
2097714-45-7
分子式
C46H58Cl2N4O
分子量
753.9
MOL 文件
2097714-45-7.mol
更新日期
2025/07/26 16:07:48
2097714-45-7 結構式
物理化學性質
外觀性狀外觀：深藍色固體
ex/em：680/698 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε)：209000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ)：0.2
溶解性：可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有機溶劑，難溶于水
ex/em：680/698 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε)：209000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ)：0.2
溶解性：可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有機溶劑，難溶于水
溶解度可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有機溶劑，難溶于水
形態(tài)Solid
顏色Purple to purplish red
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))198000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.20
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)680/698 nm (PBS buffer)
InChIKeyKVJPEAWDFIBHDL-UHFFFAOYSA-N
SMILESCC1(C(N(CCCCCC(=O)NCCCCCCN)C2C=CC3=CC=CC=C3C1=2)=CC=CC=CC1=[N+](C2C=CC3=CC=CC=C3C=2C1(C)C)C)C.[Cl-].Cl
常見問題列表
花青素熒光染料
Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一種發(fā)近紅外(NIR)熒光的花青素熒光染料。它的消光系數(shù)高，熒光也很亮，并且對pH不敏感，并且由于它的熒光波長(Em：~700nm)恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域(肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長波長穿透性強)，所以Cy5.5常應用于小動物活體體內(nèi)成像中。 Cy5.5可以用來標記蛋白，抗體，多肽，納米粒等，它最常見的使用是標記核酸分子(DNA和RNA)。熒光標記染料
Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一種發(fā)近紅外（NIR）熒光的花青素熒光染料。它的消光系數(shù)高，熒光也很亮，并且對pH不敏感，并且由于它的熒光波長（Em：~700nm）恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域（肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長波長穿透性強），所以Cy5.5常應用于小動物活體體內(nèi)成像中。 Cy5.5可以用來標記蛋白，抗體，多肽，納米粒等，它最常見的使用是標記核酸分子（DNA和RNA）。伯胺基(primary amine)是生物標記反應中常用的基團。蛋白表面賴氨酸側鏈(residue)官能團就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester)，異氰酸酯(isothiocyanate, ITC)或其它活化基團反應生成穩(wěn)定鏈接，從而把Cy5.5分子連接到目標分子上。
Cy5.5-伯胺的水溶性較低，所以在水相的標記反應體系內(nèi)需要使用有機共溶劑，常用有機溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標記的分子對有機溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy5.5-伯胺。兩者的光譜性質幾乎一致，因此大部分應用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標記反應體系內(nèi)不需要使用有機共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強標記效率。
Cy5.5-伯胺標記后的產(chǎn)物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
Cy5.5 氨基和CY5.5
Cy5.5：主要用于各種生物和生物醫(yī)學應用，如成像、體內(nèi)研究和生物分子檢測。由于其近紅外熒光性質，它特別適用于深層組織成像和背景自發(fā)熒光最小的應用。 Cy5.5-氨基：除了具有Cy5.5的熒光特性外，由于其結構中的氨基官能團，它還用于通過生物偶聯(lián)反應與生物分子進行連接。因此，Cy5.5-NH2通常用于生物標記、熒光成像和流式細胞術 等領域，以實現(xiàn)對生物分子的熒光標記和追蹤。
Cy5.5和Cy5.5-NH2都是具有近紅外熒光性質的化合物，但它們的結構和應用有所不同。Cy5.5主要利用其熒光性質進行生物成像和檢測，而Cy5.5-NH2則通過其結構中的氨基官能團與生物分子進行連接，實現(xiàn)熒光標記和追蹤。
注意事項
- Cy5.5-伯胺水溶性較低，標記反應可在有機溶劑中進行或者含有機助溶劑的水相中進行。
- 標記時使用不含氨基的緩沖體系，比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等，它們會和Cy5.5上的伯胺競爭。高濃度咪唑(imidazole)也會影響反應。
- 標記反應不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。