品名：Smart-ChIP? ChIP Kit，貨號：ChIP-1001， 品牌：EngibodyNIH、麻省理工、哈佛、斯坦福等世界名校課題組青睞并長期采購的ChIP試劑盒！Smart-ChIP? ChIP保姆級試劑盒（磁珠法）的五個巨大優(yōu)勢1、本試劑盒適用于貼壁細胞、懸浮細胞、動物組織及植物組織，均有針對性的詳細步驟可以處理這些樣本類型，是個真正的多合一Kit。2、本試劑盒包含需要交聯(lián)處理的轉錄因子類Cross-linked ChIP（超聲法，蛋白-DNA弱結合）的全部試劑。3、本試劑盒還包含無需交聯(lián)處理的組蛋白修飾類Native ChIP（MNase酶切法，蛋白-DNA強結合）的全部試劑。4、本試劑盒包含了三大ChIP下游實驗（PCR、qPCR以及NGS二代測序）的完整實驗操作方案和數據分析方案，同時本ChIP Kit中還包含了熒光定量PCR全部試劑。5、本說明書是一本ChIP實驗的全面技術手冊，透徹分析了ChIP實驗中的重點、難點，對各種重點難點問題都有針對性的解決方案。同時包含了表觀遺傳學的基礎知識和基本脈絡，匯總了各種組蛋白修飾類型的詳細信息?？赐赀@本保姆級說明書，所有疑難都會迎刃而解，ChIP盡在掌握之中。
第一部分：背景簡介及應用場景 染色質免疫沉淀 (ChIP) 技術方法是一種用于在細胞天然染色質背景下探測蛋白質-DNA 相互作用的強大技術。這種方法可以用于檢測特定轉錄因子與基因組某個啟動子元件的結合水平，也可以用于檢測整個基因組范圍內位點上某種特定組蛋白修飾水平。染色質免疫沉淀是理解染色體的一種革命性工具，使研究者可以了解染色質及其相結合的調控因子之間的時空動態(tài)相互作用。 除了組蛋白和轉錄因子以外，ChIP 技術還可用于分析轉錄輔助因子、DNA 復制因子及 DNA 修復蛋白與DNA特定區(qū)域的結合情況。進行 ChIP 實驗時，在得到特異性富集的genomic目的DNA片段后，可以在下游銜接標準 PCR實驗、定量實時 PCR實驗或者NGS二代測序。其中ChIP-qPCR和 ChIP-sequence功能尤為強大，最為常用。 1、ChIP和EMSA、DNA Pull-down、DAP-seq，這四種研究DNA-蛋白互作技術的內在關系是什么？
EMSA———電泳凝膠遷移阻滯實驗(Electrophoretic Mobility Shift Assay)，In Vitro體外通過DNA探針檢測目的蛋白，反向驗證了ChIP。是經典方法。
DNA Pull-down———In Vitro體外通過DNA探針捕獲目的蛋白或其他候選蛋白，獲取蛋白后進行WB檢測或MS質譜鑒定。也是經典方法。
DAP-seq———DNA親和純化測序，使用表達純化得到的重組靶蛋白（例如重組轉錄因子）捕獲樣本中與之相結合的所有genomic DNA片段，本質上可以理解為In Vitro體外 ChIP，適用于沒有合適ChIP抗體的情況，同時這種技術的另一個獨特優(yōu)勢是可以在全基因組范圍內Genome wide快速篩選得到可能和靶蛋白相結合的全部基因組DNA片段。這是近年來的新興技術。
2、ChIP和CUT&RUN、CUT&Tag，這三種DNA-蛋白互作技術之間的比較CUT&RUN、 CUT&Tag都是研究DNA和蛋白互作的新技術，是2017年由美國弗雷德癌癥中心的Henikoff教授開發(fā)的新技術，受到廣泛關注，這個技術是ChIP技術的強大補充，適用于低細胞用量的實驗，只需要100個-10萬個細胞的樣本即可實施實驗，而ChIP需要百萬級細胞才能實施。所以CUT&RUN、 CUT&Tag對于難以獲得足夠細胞樣本的實驗者來說是個好消息，但是這兩種新技術雖然原理巧妙，但操作步驟較為復雜，試劑盒較貴，而且因為是全程微量操作，需要添置不少專門的儀器設備（Qseq 100或安捷倫bioanalyzer 2100等）。對于不難獲得樣本細胞的實驗者而言，傳統(tǒng)經典ChIP技術仍然有其不可替代的獨特優(yōu)勢，操作較為簡單，步驟成熟，無需額外添置昂貴的專門儀器，實驗成本大大降低。 3、ChIP-seq和RNA-seq的聯(lián)合分析這是經典研究策略，讓ChIP-seq的轉錄調控環(huán)節(jié)與最終細胞內mRNA實際水平進行比較，互相印證。第二部分：技術原理和技術流程技術原理：
染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation Assay, ChIP）的基本原理是在活細胞狀態(tài)下把細胞內的蛋白質和DNA交聯(lián)，超聲波或酶切將其隨機切斷為一定長度范圍內的染色質小片段，然后用所研究的目的蛋白質抗體免疫沉淀蛋白質-DNA復合體，從而特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，以便用于下游的PCR分析和Sequence測序。
ChIP-qPCR用于檢測通過蛋白特異性免疫沉淀富集得到的特定 DNA 序列的相對數量。ChIP-sequence能對蛋白-DNA 相互作用和組蛋白修飾進行全基因組范圍內的分析。
兩大技術路線：因為：甲醛交聯(lián)后的染色質對限制性內切酶、MNase及DNase I高度抵抗，不易被酶切斷。通常需要使用超聲波來物理打斷染色質。 所以：根據實驗者研究的目的蛋白不同，采用2種不同的技術路線1、如果研究的是轉錄因子，轉錄因子和啟動子DNA元件的結合一般都是弱結合，是容易解離的，且轉錄因子在細胞內的豐度較低，所以一般采用甲醛固定交聯(lián)轉錄因子和DNA，超聲打斷得到染色質小片段的技術流程。 2、如果研究的是組蛋白甲基化或乙酰化修飾，細胞內豐度較高，且DNA纏繞在組蛋白上，是相對強結合，不易解離，因此一般無需甲醛固定交聯(lián)，MNase (Micrococcal Nuclease) 酶切即可得到染色質小片段。第三部分：ChIP試劑盒組分清單（共計19個組分，均可單獨購買）
實驗結果展示：1、ChIP-PCR2、ChIP-qPCR3、ChIP-測序Smart-ChIP? ChIP kit 保姆級ChIP試劑盒官網詳細頁面：https://www.engibody.com/products/Smart-ChIP-ChIP-Kit.html 注意：本試劑盒僅用于科學研究，不用于臨床診斷。
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