2230212-27-6
中文名稱
Sulfo-Cy5 NHS酯
英文名稱
Sulfo-Cy5 NHS Methyl type | Lumiprobe type
CAS
2230212-27-6
分子式
C36H42KN3O10S2
分子量
779.96
MOL 文件
2230212-27-6.mol
更新日期
2025/08/15 15:58:18
2230212-27-6 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
磺化CY5 NHS磺化CY5-NHS 活化酯
SULFO-CY5 NHS酯
MECY5-NHS ESTER POTASSIUM
SULFO-CY5 NHS METHYL TYPE| LUMIPROBE 同款
英文別名
ulfo-Cy5 NHS Methyl typeMeCY5-NHS ester potassium
Sulfo-Cy5 NHS Me, Cyanine5 NHS Me
Sulfo-Cyanine5 NHS ester potassium
Sulfo-Cy5 NHS Methyl type | Lumiprobe type
Potassium 1-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-3,3-dimethyl-2-(5-(1,3,3-trimethyl-5-sulfonatoindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
所屬類別
醫(yī)藥中間體：原料藥中間體物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深藍(lán)色固體
ex/em : 649/672 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 271000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.28
ex/em : 649/672 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 271000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.28
溶解度Soluble in Water, DMSO, DMF, DCM
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))271000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.28
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)649/672 nm (PBS buffer)
InChIKeyXSUITALZBVEBJZ-UHFFFAOYSA-N
SMILESC([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C12)C=CC=CC=C1N(C2=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C2C1(C)C)C)CCCCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O.[KH]
常見問題列表
概述
Sulfo-Cy5 NHS酯 是一種活性染料，可用于標(biāo)記蛋白核酸,具有水溶性。熒光標(biāo)記染料
磺化Cy5是Cy5(Cyanine 5)的水溶型。它的光譜性質(zhì)和Cy5類似，在熒光顯微鏡下發(fā)遠(yuǎn)紅色熒光。它熒光亮，對(duì)pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激發(fā)然后用 Cy5或APC濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用?；腔疌y5熒光落在遠(yuǎn)紅光區(qū)，使用磺化Cy5或者其它遠(yuǎn)紅光染料的一個(gè)重要優(yōu)勢是在這個(gè)長波長光譜范圍內(nèi)樣品背景熒光較低，而在這個(gè)區(qū)域CCD相機(jī)/檢測器檢測靈敏度最高?；腔疌y5-NHS可以用來標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，核酸分子等。由于它的良好水溶性，它比普通Cy5-NHS更適合標(biāo)記蛋白。NHS活化酯 （N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物標(biāo)記反應(yīng)中最常用的活化基團(tuán)。它活化Cy5分子中的羧基，讓它可以和目標(biāo)生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反應(yīng)生成穩(wěn)定的酰胺鍵，從而把磺化Cy5分子標(biāo)記到生物大分子上。由于游離胺基是蛋白，抗體，多肽表面的常見官能團(tuán)（來自于賴胺酸側(cè)鏈），磺化Cy5-NHS可以和它們直接反應(yīng)。核酸分子中天然不帶游離胺基，只有胺基修飾過的RNA或者DNA才可以和磺化Cy5-NHS反應(yīng)。
磺化Cy5-NHS活化酯的水溶性極高，所以在標(biāo)記反應(yīng)中不需要使用有機(jī)共溶劑，特別適合標(biāo)記蛋白等對(duì)有機(jī)溶劑敏感的生物分子。另外磺化Cy5水溶性極好，并且染料分子本身帶電荷，標(biāo)記到蛋白表面后不會(huì)引發(fā)疏水性蛋白聚集，提高熒光標(biāo)記產(chǎn)物的穩(wěn)定性?；腔疌y5-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有機(jī)溶劑，標(biāo)記反應(yīng)也可以在純有機(jī)溶劑中進(jìn)行。
磺化Cy5-NHS標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
注意事項(xiàng)
- NHS ester基團(tuán)對(duì)濕度比較敏感，務(wù)必干燥保存產(chǎn)品。使用前產(chǎn)品需放到室溫回溫至少20分鐘。
- 使用不含氨基的緩沖體系。比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等。高濃度咪唑(imidazole)也會(huì)影響反應(yīng)。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因?yàn)榇蟛糠譄晒饣衔镌趶?qiáng)光下長時(shí)間照射會(huì)緩慢光漂泊(photobleaching)。